Zapata meddelade 15 juni att han lämnar posten som kulturråd, efter den opinionsstorm som några fyra år gamla twitter-inlägg väckt. Samma dag som den nya kommunstyrelsen i Madrid tillsattes återgav flera medier inlägg på Twitter från 2011 av Zapata där han skämtar om både judar och terroristoffer. Ett av skämten säger "Hur får man in fem miljoner judar i en seiscientos? – I askfatet."

Guillermo Zapata bad omedelbart om ursäkt och uppgav att skämten var markerade inom citattecken och publicerades inom ramen för en debatt om den svarta humorns gränser. Nya borgmästaren Manuela Carmena uppgav dock att det finns en gräns för humor och efter ett möte med Zapata valde denne att självmant avgå, mindre än två dygn efter att han tillträdde posten.

Zapata behåller dock fullmäktigeposten och kommer att ha ansvar för ett av Madrids kvarter. En annan av de nya representanterna i Madrids kommunstyrelse sitter dock kvar, trots att han själv önskade livet av Madrids tidigare borgmästare Alberto Ruiz Gallardón, också via Twitter.