Den baskiska koalitionsregeringen hamnade i minoritet vid det senaste regionalvalet och efter att oppositionspartierna i flera omröstningar vägrat acceptera att Atutxa omvaldes, tvingades PNV presentera en alternativ kandidat. Atutxa blev föremål för hård kritik när han förra mandatperioden vägrade åtlyda Högsta domstolens order att upplösa Batasunagruppen i regionalparlamentet.

Den före detta talmannen, som även varit baskiskt justitieråd, är kallad till förhör 26 oktober på grund av hans vägran att lyda HD. Han förnekar dock att avgången skulle ha med processen att göra.