Mariano Rajoy var vice regeringschef när Prestigekatastrofen inträffade, i november 2003. Oljeutsläppet fick en enorm spridning efter den spanska regeringens beslut att bogsera fartyget ut på öppet hav, där det senare förliste. PP-regeringen har vidhållit att beslutet baserades på expertutlåtanden, men den ett år långa Prestigeutredningen i parlamentet antyder motsatsen, samt fastställer att beslutet att bogsera bort fartyget från kusten togs från första stund.

Vänsterledaren Gaspar Llamazares kräver att både Rajoy och dåvarande näringsministern Francisco Álvarez Cascos ställs till svars för sina beslut. Socialistpartiets sekreterare José Blanco styrker initiativet.
Rajoy säger att han inte har några problem med att försvara den förra regeringens agerande. Han hävdar dock att anklagelserna är ett försök att dölja de verkliga problem som skakar Spanien och den nuvarande socialistregeringen.