Alonso var jurist och domare under 25 år, innan han värvades som minister av José Luís Rodríguez Zapatero. Efter att ha verkat som inrikesminister 2004-2007 och försvarsminister 2007-2008 blev han utsedd till socialistpartiets talesman i parlamentet.

José Antonio Alonso lämnade 2012 sin politiska karriär och led sedan en tid av lungcancer.